Ученые из питерского Университета ИТМО обнаружили в микрофлоре кишечника гены бактерий, устойчивых к антибиотикам. Оказалось, что это одна из инкубационных сред таких «супербактерий» наряду с животноводческими фермами и больницами. В случае кишечника человека микробы, которые часто контактируют с антибиотиками, хоть и являются безвредными или полезными, вырабатывают устойчивость к лекарствам, которую потом могут передать болезнетворным бактериям. Об этом говорится в статье, опубликованной в журнале Bioinformatics.
В отличие от обычных способов анализировать метагеном, которые не позволяют узнать откуда появился и как передался ген устойчивости к антибиотикам, новая программа отечественных ученых позволяет проводить анализ отдельных генов «супербактерий». Кроме того MetaCherchant может выявить в метагенной субстанции аналоги генов и их прародителей.
Исследователи уже обнаружили прародителей штамма Helicobacter pylori, устойчивого к лекарствам и вызывающего инфекции желудка и злокачественные опухоли.
Новый подход позволит исследовать эволюцию микроорганизмов кишечника и искать варианты борьбы с невосприимчивыми к антибиотикам микробами.